按照《中华人民共和国中外合作办学条例》的规定：中外合作办学通常是指外国教育机构同中国教育机构在中国境内合作举办的以中国公民为主要招生对象的教育机构或项目的活动。目前，学校拥有教育部批准的中外合作办学机构1个，中外合作办学项目4个。
类别 | 机构/项目名称 | 办学层次 | 获批时间 | 备注 |
中外合作 办学机构 | 南京航空航天大学伦敦国际学院 | 本科、硕士、博士 | 2025 | 2025年开始招生 |
中外合作 办学项目 | 南京航空航天大学与英国伦敦城市大学合作举办自动化专业本科教育项目 | 本科 | 2011 | 江苏省第二批中外合作办学高水平示范性建设工程（2017） |
南京航空航天大学与澳大利亚皇家墨尔本理工大学合作举办交通运输专业本科教育项目 | 本科 | 2012 | 江苏省第二批中外合作办学高水平示范性建设工程（2016） | |
南京航空航天大学与英国克兰菲尔德大学合作举办机械（航空工程）专业硕士研究生教育项目 | 硕士 | 2018 | 2019年开始招生 | |
南京航空航天大学与法国巴黎高等电子学院合作举办软件工程专业硕士研究生教育项目 | 硕士 | 2025 |
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