按照《中华人民共和国中外合作办学条例》的规定：中外合作办学通常是指外国教育机构同中国教育机构在中国境内合作举办的以中国公民为主要招生对象的教育机构或项目的活动。目前，学校拥有教育部批准的中外合作办学项目3个：
项目名称 | 办学层次 | 获批时间 | 毕业 人数 | 备注 |
南航-伦敦城市大学自动化(航空电子与控制)本科中外合作办学项目 | 本科 | 2011 | / | 江苏省第二批中外合作办学高水平示范性建设工程（2017） |
南航-澳大利亚皇家墨尔本理工大学（交通运输）本科中外合作办学项目 | 本科 | 2012 | / | 江苏省第二批中外合作办学高水平示范性建设工程（2016） |
南航-英国克兰菲尔德大学航空制造(航空工程)专业硕士研究生教育项目 | 硕士 | 2018 | / | 2019年开始招生 |
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